2018-01-01から1年間の記事一覧

AWS EFSのファイル読み込みのスループットを計測する

AWS EFS Oregon regionのファイル読み込みのスループットを計測する。複数のEC2から同時にファイルを読み込んだ場合のスループットも計測する。 また、すべてのEFSは100 MiB/秒のスループットまでバーストするとマニュアルに記載があるが、読み込み時にバー…

Azure Batch サンプルプログラムのカスタマイズ

目的 Azure Batchのpythonサンプルプログラムを、ゲノムシークエンスデータ解析に使いやすいようにカスタマイズしたのでメモしておく。 カスタマイズしたプログラム github.com オリジナルのサンプルプログラム github.com azurebatchmonの実行環境 Azure 仮…

Salt StackでGoogle Cloud Platform (GCP) をマネージメントしたい

E 目的 インフラ構成管理ソフトについて勉強中。AWSで使ってみて、使用感が良かったので、GCPでも使用してみる。 この記事でやること SaltStackの公式ドキュメント [Getting Started With Google Compute Engine] をやってみる。 Salt StackでGCPをマネージ…

Azure BatchでDNAシークエンスデータをアライメントしてみる

目的 Azure BatchでDNAシークエンスデータをアライメントしてみる。勉強目的。 この記事でやること Azure Batchでbwaを実行してみる。以下の記事に沿って勉強する。 チュートリアル - Python 向け Azure Batch SDK を使用する | Microsoft Docs インストール…